Detailed information of deep learning profile BP001415.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for PKNOX1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: PKNOX1
Model ID: BP001415.1
Cell line: MCF-7
Class: Homeo domain factors
Family: TALE-type homeo domain factors
JASPAR ID: MA0782.3
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P55347  
Source: ENCODE
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

Contribution weight matrix (CWM)

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Hypothetical CWM

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Unique motifs

3 profiles found for the same TF (PKNOX1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Cell line Species JASPAR ID Sequence logo
BP000602.1 PKNOX1 K562 Homo sapiens MA0782.3
BP000714.1 PKNOX1 HEK293T Homo sapiens MA0782.3
BP001157.1 PKNOX1 GM12878 Homo sapiens MA0782.3
Showing 3 profiles of page 1 from 1 pages
  • 1 (current)