Detailed information of deep learning profile BP000326.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CUX1 in GM12878 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: CUX1
Model ID: BP000326.1
Cell line: GM12878
Class: Homeo domain factors
Family: HD-CUT
JASPAR ID: MA0754.3
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P39880  
Source: ENCODE
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

Contribution weight matrix (CWM)

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Hypothetical CWM

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Unique motifs

3 profiles found for the same TF (CUX1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Cell line Species JASPAR ID Sequence logo
BP000400.1 CUX1 K562 Homo sapiens MA0754.3
BP000501.1 CUX1 MCF-7 Homo sapiens MA0754.3
BP000659.1 CUX1 K562 Homo sapiens MA0754.3
Showing 3 profiles of page 1 from 1 pages
  • 1 (current)