Detailed information of deep learning profile BP000217.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in H54 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: CTCF
Model ID: BP000217.1
Cell line: H54
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA0139.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P49711  
Source: ENCODE
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

Contribution weight matrix (CWM)

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Hypothetical CWM

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Unique motifs

448 profiles found for the same TF (CTCF) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Cell line Species JASPAR ID Sequence logo
BP000011.1 CTCF myotube Homo sapiens MA0139.2
BP000012.1 CTCF HeLa-S3 Homo sapiens MA0139.2
BP000013.1 CTCF astrocyte Homo sapiens MA0139.2
BP000014.1 CTCF osteoblast Homo sapiens MA0139.2
BP000015.1 CTCF fibroblast of dermis Homo sapiens MA0139.2
BP000016.1 CTCF DND-41 Homo sapiens MA0139.2
BP000018.1 CTCF CD14-positive monocyte Homo sapiens MA0139.2
BP000019.1 CTCF A549 Homo sapiens MA0139.2
BP000020.1 CTCF A549 Homo sapiens MA0139.2
BP000021.1 CTCF B cell Homo sapiens MA0139.2
Showing 10 profiles of page 2 from 45 pages