Detailed information of deep learning profile BP000054.1

  1. Home
  2. Deep Learning Profile > BP000054.1
This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for GABPA in H1 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: GABPA
Model ID: BP000054.1
Cell line: H1
Class: Tryptophan cluster factors
Family: Ets-related
JASPAR ID: MA0062.4
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q06546  
Source: ENCODE
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

Contribution weight matrix (CWM)

     
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Frequency matrix

         
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Hypothetical CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

PFM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

CWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

HCWM

       
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Unique motifs

13 profiles found for the same TF (GABPA) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Cell line Species JASPAR ID Sequence logo
BP000043.1 GABPA HeLa-S3 Homo sapiens MA0062.4
BP000062.1 GABPA HepG2 Homo sapiens MA0062.4
BP000088.1 GABPA K562 Homo sapiens MA0062.4
BP000126.1 GABPA A549 Homo sapiens MA0062.4
BP000178.1 GABPA SK-N-SH Homo sapiens MA0062.4
BP000180.1 GABPA HL-60 Homo sapiens MA0062.4
BP000192.1 GABPA MCF-7 Homo sapiens MA0062.4
BP000526.1 GABPA liver Homo sapiens MA0062.4
BP000527.1 GABPA MCF-7 Homo sapiens MA0062.4
BP000758.1 GABPA HepG2 Homo sapiens MA0062.4
Showing 10 profiles of page 1 from 2 pages