Detailed information of deep learning profile BP000034.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for PAX5 in GM12878 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: PAX5
Model ID: BP000034.1
Cell line: GM12878
Class: Paired box factors
Family: Paired domain only
JASPAR ID: MA0014.4
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q02548  
Source: ENCODE
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

Contribution weight matrix (CWM)

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Hypothetical CWM

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Unique motifs

3 profiles found for the same TF (PAX5) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Cell line Species JASPAR ID Sequence logo
BP000038.1 PAX5 GM12878 Homo sapiens MA0014.4
BP000059.1 PAX5 GM12891 Homo sapiens MA0014.4
BP000060.1 PAX5 GM12892 Homo sapiens MA0014.4
Showing 3 profiles of page 1 from 1 pages
  • 1 (current)