Detailed information of deep learning profile BP000010.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in fibroblast of lung using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: CTCF
Model ID: BP000010.1
Cell line: fibroblast of lung
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA0139.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P49711  
Source: ENCODE
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

Contribution weight matrix (CWM)

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Hypothetical CWM

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Number of seqlets:

A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]
A [ ]
C [ ]
G [ ]
T [ ]

Unique motifs

448 profiles found for the same TF (CTCF) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Cell line Species JASPAR ID Sequence logo
BP000609.1 CTCF SU-DHL-6 Homo sapiens MA0139.2
BP000611.1 CTCF neural progenitor cell Homo sapiens MA0139.2
BP000615.1 CTCF A549 Homo sapiens MA0139.2
BP000617.1 CTCF lower lobe of left lung Homo sapiens MA0139.2
BP000622.1 CTCF heart right ventricle Homo sapiens MA0139.2
BP000626.1 CTCF thyroid gland Homo sapiens MA0139.2
BP000629.1 CTCF gastroesophageal sphincter Homo sapiens MA0139.2
BP000637.1 CTCF HCT116 Homo sapiens MA0139.2
BP000639.1 CTCF CD14-positive monocyte Homo sapiens MA0139.2
BP000642.1 CTCF HFFc6 Homo sapiens MA0139.2
Showing 10 profiles of page 16 from 45 pages